神樱大祓任务的开启需要先在绀田村西北方向的狐狸神像处找到巫女花散里，与她对话触发任务。花散里会请求玩家调查绀田村的异常现象，这是整个任务的起点。随后需要与村内的双叶、村长绀田传助、今谷三郎、柴门慧里以及房顶上的小猛对话，获取关于村内怪事的线索。完成对话后，需在村长家后院井边找到摩拉钱袋，并根据小猛的提示收集残破货物清单和水中货物袋三个证据，用于与村长对质。
收集完证据后，需前往村长家房顶获取笔记，根据笔记提示找到枯井位置。使用老旧的钥匙开启井锁后进入井底探索。井底存在紫色结界，需通过雷种子穿越或直接钻过墙洞进入。在结界后的鸟居处放入镇物，调整各石台上勾玉的数量，使祝祷图案与鸟居显示的图案一致。击败出现的落武者后，任务第一阶段完成，但需注意鸟居右侧雷结界后还藏有华丽宝箱和锈蚀钥匙，后者是后续任务的关键道具。
第二阶段任务需前往绀田村东北方的荒废神社。在神社内与三个谜样人影各对话两次，使其汇聚在狐狸雕像处。随后前往鸣神大社获取小道具留念镜，返回荒废神社调查发光的地狐雕像。通过留念镜可看到过去影像，最终获得三句言灵：鸣神敕使白辰血脉油豆腐，速速来。对天狐雕像按顺序念出言灵后取得镇物，用锈蚀钥匙打开神社结界门，再次完成祝祷图案调整即可净化该处雷樱树根。
后续需依次完成镇守之森、荒海及神里屋敷滩涂地下的结界净化。镇守之森需寻找三只变化为物体的妖狸，通过元素视野追踪并点燃火盆或破坏木桶使其现形；荒海需点亮四个雷元素方碑开启机关，用留念镜照射地狐雕像激活隐藏机关；神里屋敷滩涂则需通过留念镜照射地狐打开通道。每处结界均需放入对应镇物并调整祝祷图案，最终向花散里复命。
最终阶段需前往影向山底部裂口，与花散里对话后跳入洞窟击败瘴晦瘤。战斗中需完成三次祝祷，每次成功会迫使瘴晦瘤下坠。击败后与花散里完成最终对话，拾取面具即可获得成就异人祓行芝居，整个神樱大祓任务至此全部完成。
